Alternance - Technicien en biologie moléculaire, microbiologie (H/F)

Date limite de dépôt des candidatures : L'unité Ifremer IHPE est intégrée dans une Unité Mixte de Recherche (UMR 5244, créée depuis 2015 entre plusieurs institutions de recherche : Ifremer, CNRS, Université de Montpellier et Université de Perpignan via Domitia. Les objectifs scientifiques de cette Unité visent d'une part à décrire les mécanismes qui gouvernent les interactions entre les invertébrés marins (principalement l'huître creuse), leurs agents pathogènes et l'environnement, notamment lors d'épisodes infectieux, et d'autre part à caractériser les réponses physiologiques et adaptatives de ces animaux et de leurs agents pathogènes face aux pressions environnementales. Vous apporterez un soutien technique aux projets de l'équipe TREV (Transmission, Résistance et Virulence) sur le site de Montpellier pour la caractérisation des facteurs génétiques impliqués dans la virulence des Vibrio pathogènes de l'huître creuse Magallana gigas. Vous serez intégré(e) au sein de l'unité IHPE et placé(e) sous la responsabilité directe d'un(e) chercheur(e)/enseignant(e)-chercheur(e) encadrant le projet. Vous travaillerez en interaction étroite avec les ingénieurs, techniciens et doctorants impliqués dans les approches de génétique bactérienne et de biologie moléculaire. Votre mission consistera à participer à la mise en œuvre d'approches de génétique bactérienne et de biologie moléculaire visant à identifier les gènes impliqués dans la virulence de bactéries marines. Vous contribuerez notamment au développement d'un criblage génétique basé sur la construction et l'analyse de banques de mutants par insertion de transposon (méthode dite TnSeq - Transposon Sequencing). Dans ce cadre, vous participerez à :

• la manipulation et la culture de bactéries marines,
• la construction et le suivi de banques de mutants,
• la réalisation d'analyses de biologie moléculaire,
• la production de données expérimentales nécessaires aux projets de recherche de l'équipe.

Quelles seront vos activités ?

• Culture, entretien et manipulation de souches bactériennes (Vibrio spp.)
• Réalisation de techniques de microbiologie classiques (ensemencements, isolements, dénombrements)
• Extraction d'ADN génomique
• Réalisation de PCR et analyses par électrophorèse
• Participation à la construction et à la validation de banques de mutants
• Préparation d'échantillons pour séquençage
• Participation aux tests phénotypiques in vitro (croissance, stress environnementaux)
• Saisie, organisation et traçabilité des données expérimentales
• Participation aux réunions d'équipe

Vous bénéficierez d'un encadrement technique et scientifique permettant une montée progressive en autonomie. Champs relationnel En interne :

• Chercheurs et enseignants-chercheurs de l'équipe TREV et du site de Montpellier
• Ingénieurs et techniciens de l'unité IHPE
• Doctorants et post-doctorants
• Plateformes techniques de l'unité

En externe :

• Plateformes de biologie moléculaire et de séquençage
• Partenaires académiques du projet

Comment se déroulera votre activité ?

• Activité exercée principalement en laboratoire de microbiologie et biologie moléculaire.
• Travail en environnement confiné adapté à la manipulation de bactéries.
• Poste basé à Montpellier (Centre Ifremer Méditerranée - Université de Montpellier).
• Pas de télétravail (activité expérimentale).
• Déplacements ponctuels possibles vers des plateformes techniques régionales.
• Encadrement quotidien par un membre expérimenté de l'équipe
• 12 RTT et congés supra-légaux
• Politique RSE engagée (forfait mobilité durable, qualité de vie au travail)
• Environnement scientifique stimulant au sein d'un laboratoire de recherche reconnu
• Encadrement scientifique personnalisé
• Accès à des plateformes technologiques de pointe

Diplôme préparé :

• BUT Génie Biologique
• BTS Biotechnologies
• BTS Analyses de Biologie Médicale
• Licence professionnelle en biotechnologies ou microbiologie

Une première expérience en laboratoire (stage académique) est appréciée. Vous avez les compétences, connaissances et expériences suivantes :

• Bases en microbiologie et biologie moléculaire
• Connaissance des techniques de PCR et d'extraction d'ADN
• Maîtrise des règles d'hygiène et de sécurité en laboratoire
• Rigueur dans la manipulation et la traçabilité des échantillons
• Utilisation courante d'outils bureautiques

La connaissance des techniques de génétique bactérienne constitue un plus mais n'est pas obligatoire. Vous avez les qualités suivantes :

• Rigueur et sens de l'organisation
• Esprit d'équipe
• Curiosité scientifique
• Motivation pour la recherche appliquée
• Capacité à suivre des protocoles expérimentaux
• Fiabilité et sens des responsabilités