Post-doctorant-e en biologie moléculaire et cellulaire

Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales , implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Contexte de travail
Les systèmes agricoles doivent aujourd’hui relever un double défi : renforcer leur résilience face aux stress biotiques et abiotiques tout en réduisant l’usage des intrants chimiques dans un contexte de transition agroécologique. Les cultures pérennes tropicales et méditerranéennes - telles que le bananier, les agrumes, ou la vigne - sont particulièrement exposées aux changements environnementaux (dérèglement climatique, évènements extrêmes, émergence de nouveaux pathogènes). Le développement de variétés génétiquement résistantes constitue ainsi une priorité stratégique pour assurer la durabilité de ces filières. Dans cette dynamique, le projet GARDENS (PEPR SVA) promeut l’intégration raisonnée des nouvelles techniques génomiques (NGT), notamment l’édition du génome, au sein de systèmes vergers-maraîchers innovants. L’édition génomique représente un levier puissant pour accélérer l’amélioration variétale et cibler précisément des gènes impliqués dans la résistance aux pathogènes ou l’adaptation aux contraintes environnementales. Cependant, chez les plantes pérennes et clonales, plusieurs verrous techniques limitent encore son déploiement : cycles biologiques longs, régénération in vitro fortement génotype-dépendante, risques de chimérisme, difficulté d’élimination des séquences transgéniques et contraintes réglementaires spécifiques. Dans ce contexte, le développement de stratégies d’édition du génome DNA-free - reposant notamment sur l’utilisation de complexes ribonucléoprotéiques (RNP), la transfection transitoire ou la régénération à partir de protoplastes - constitue une approche particulièrement innovante. Elle permet d’obtenir des plantes éditées sans insertion stable d’ADN exogène, réduisant les délais d’obtention, limitant les effets hors cible liés à l’intégration et facilitant leur acceptabilité sociétale ainsi que leur futur déploiement

Missions
Vous serez chargé.e de conduire des travaux de recherche en biologie moléculaire et cellulaire visant à (1) développer et optimiser des stratégies d’édition du génome DNA-free chez plusieurs espèces pérennes, (2) identifier et valider des gènes impliqués dans les interactions intra-système vergers-maraîchers (interactions plante-plante et/ou plante-environnement).

Activités techniques
• Concevoir des systèmes CRISPR/Cas sous forme de complexes ribonucléoprotéiques (RNP)
• Mettre en oeuvre des protocoles de transformation de protoplastes
• Optimiser les protocoles de régénération via embryogenèse somatique
• Valider les événements d’édition par PCR ciblée et séquençage NGS
• Participer aux essais en conditions confinées et au phénotypage des plantes éditées
• Rédiger des articles scientifiques et contribuer aux rapports de projet
• Contribuer aux comptes rendus du projet, ainsi qu’aux actions de communication et de transfert de connaissances

Environnement de travail
Les travaux seront réalisés au sein de l’unité de recherche AGAP Institut qui mène des recherches sur l’amélioration génétique et l’adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales. Vous serez rattaché aux équipes ADAPPTE (Mécanismes d’adaptation des plantes pérennes aux changements environnementaux), DAAV (Diversité, adaptation et amélioration de la vigne) et GABA (Génétique et amélioration des bananiers) à Montpellier, et vous travaillerez également avec l’entreprise de biotechnologie Vitropic. Vous bénéficierez de l'appui et de l'expérience de biologistes moléculaires et cellulaires, génomiciens, physiologistes, bioinformaticiens et agronomes au sein de l’UMR AGAP Institut, et des dispositifs de la plateforme d’analyse fonctionnelle et édition du génome (AFEG).

Travail sur écran + 4h

Formations et compétences recherchées

Doctorat

Titulaire d'un doctorat en biologie moléculaire, biologie cellulaire, biochimie et/ou agronomie

Connaissances
• Formation en biologie moléculaire, cellulaire, biochimie et/ou agronomie
• Maîtrise de techniques de clonage et de transformation génétique végétale
• Connaissance des principes de l’édition du génome (CRISPR/Cas)
• Expérience en culture in vitro et régénération végétale
• Connaissance des annotations structurales de gènes, expérience de manipulation de fichiers ainsi que d’outils de comparaisons de séquences (BLAST, alignement)

Connaissances complémentaires
• Connaissances des techniques de qPCR, HRM
• Connaissances en physiologie des plantes pérennes
• Connaissances en analyse d’image

Compétences comportementales
• Capacités organisationnelles
• Créativité et esprit d'initiative
• Capacités relationnelles et d’adaptation à différents contextes
• Intérêt pour le travail en équipe

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation , conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. > En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr