Doctorant-e en écophysiologie de la vigne et modélisation du carbone

Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales , implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous rejoindrez l'Unité Mixte de Recherche Laboratoire d'Ecophysiologie des Plantes sous Stress Environnementaux (LEPSE) et serez accueilli-e au sein de l'équipe ETAP, spécialisée dans l'étude du fonctionnement de la vigne et de leur adaptation aux changements environnementaux. Vous serez inscrit-e à l'école doctorale GAIA et bénéficierez d'un environnement scientifique stimulant ainsi que d'un vaste réseau collaboratif dans le domaine de la vigne et du vin. Les travaux expérimentaux au champ seront conduits en collaboration avec l'Unité Expérimentale Pech Rouge, tandis que les expérimentations sur plateformes seront menées en lien avec l'équipe M3P. Vous bénéficierez également des interactions développées au sein de la filière Vigne & Vin de l'Institut Agro et du réseau de modélisateurs associé à la plateforme OpenAlea pour les travaux de développement des modèles.

Le secteur viticole français connaît une forte variabilité interannuelle ainsi qu'une baisse de sa production. Les épisodes de sécheresse et de fortes chaleurs, désormais plus fréquents et plus intenses, pourraient entraîner un épuisement progressif des réserves carbonées de la vigne et contribuer à expliquer cette diminution des rendements. Ces réserves jouent un rôle central dans le fonctionnement des plantes pérennes : elles permettent de stocker des assimilats lorsque leur production est excédentaire et de les mobiliser lorsque les besoins dépassent les ressources disponibles. La succession d'événements climatiques affectant la photosynthèse pourrait ainsi conduire à un épuisement progressif des réserves et impacter durablement la production. Mieux comprendre l'impact de la répétition des stresses (effet mémoire ») au cours d'un ou plusieurs cycles de culture, sur la mise en réserve, constitue un enjeu majeur pour améliorer la gestion des pratiques culturales et identifier des variétés de vigne plus résilientes face au changement climatique.

Cette thèse vise à mieux comprendre les mécanismes par lesquels des épisodes répétés de sécheresse et de fortes chaleurs modifient le fonctionnement carboné de la vigne. Les travaux chercheront notamment à caractériser les effets de « mémoire » des stress sur plusieurs cycles de culture, à préciser le rôle des réserves carbonées dans le maintien de la croissance et de la pérennité des plantes, et à analyser la variabilité des réponses entre génotypes. Ces connaissances contribueront à améliorer la prédiction des performances de la vigne dans un contexte de changement climatique et à accompagner l'adaptation des pratiques culturales ainsi que l'identification de génotypes plus résilients.

Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :

Expérimentation et acquisition de données

• Concevoir et mettre en œuvre une campagne expérimentale sur deux cycles culturaux consécutifs.
• Conduire des travaux d'expérimentations conduites en conditions contrôlées et au champ sur un large panel de génotypes.
• Mettre en œuvre des scénarios de stress hydriques et thermiques répétés et réaliser des mesures physiologiques régulières afin de caractériser les dynamiques de croissance, de gain de carbone et de mobilisation des réserves.

Modélisation et analyse des données

• Exploiter les bases de données issues de ces expérimentations.
• Développer des formalismes permettant de simuler l'évolution des réserves carbonées de la vigne sous stress répétés.
• Intégrer ces développements dans des modèles existants de fonctionnement et d'allocation de biomasse.
• Analyser et interpréter les résultats obtenus afin d'améliorer la compréhension des mécanismes étudiés.

Des déplacements ponctuels sont à prévoir pour la conduite des expérimentations sur les plateformes de phénotypage et sur le site expérimental de Pech Rouge, ainsi que pour collaborer avec les équipes partenaires du projet.

Formations et compétences recherchées

Master/Ingénieur (Bac+5)

Vous êtes titulaire d'un diplôme d'ingénieur agronome ou d'un master en agronomie, en biologie végétale ou dans un domaine en lien avec l'écophysiologie des plantes.

Savoir-faire :

• Disposer de connaissances en écophysiologie végétale, notamment sur le métabolisme carboné et les relations hydriques chez les plantes.
• Mettre en place et assurer le suivi d'expérimentations en conditions contrôlées et au champ.
• Nettoyer, traiter et analyser des données expérimentales.
• Utiliser des outils de programmation en Python ou en R, avec ou sans assistance d'outils d'intelligence artificielle.
• Rédiger des documents scientifiques et communiquer des résultats en anglais.

Savoir-être :

• Apprécier le travail en équipe et les collaborations interdisciplinaires.
• Faire preuve de rigueur, d'autonomie et d'organisation dans la conduite d'un projet de recherche.
• Être curieux-se scientifiquement et disposer de bonnes capacités d'analyse, de synthèse et de rédaction.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation , conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. > En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr