Ingénieur en expérimentation et instrumentation biologiques (F/H)
À propos de nous Une université d'excellence Université de recherche intensive, leader mondial en écologie, l'Université de Montpellier est un établissement public expérimental qui figure dans le top 200 du classement de Shanghai. Elle couvre plusieurs champs disciplinaires sciences et techniques, droit, économie, environnement, administration, gestion, médecine, pharmacie, activités physiques et sportives, biologie, informatique, sciences de l'éducation, science politique. Elle a obtenu en 2022 la labellisation I-SITE (Initiative Science Innovation Territoires Economie) qui associe 15 partenaires de recherche et d'innovation du territoire. Ce Programme d'Excellence (PEI) porté par l'Université de Montpellier s'articule autour des enjeux "Nourrir, Soigner, Protéger" et s'appuie sur tous les domaines scientifiques de l'Université et de ses partenaires. Elle coordonne le Pôle Universitaire d'Innovation (PUI). Une université engagée Vigilante envers toutes formes de discriminations, l'Université de Montpellier est engagée pour la promotion de la diversité, l'égalité entre femmes et hommes et pour l'inclusion des personnes en situation de handicap. Elle est attachée aux fondements du service public, à la laïcité, à l'égalité des chances et à l'accès de tous aux savoirs. Elle promeut les valeurs académiques telles que l'éthique, l'intégrité scientifique et la liberté universitaire. L'UM place enfin le développement durable au cœur de sa politique et de son savoir-vivre. Une démarche saluée par le palmarès du Times Higher Education qui la place en tête des universités françaises les plus performantes en terme de développement durable. Dans le cadre de ses engagements, l'université promeut le CV sans photographie. Structure de rattachement : Laboratory of Pathogens and Host Immunity (LPHI) Mission Intitulé du projet : Le paludisme tue un demi-million d'enfants par an, cependant dans les zones endémiques, la plupart des infections par Plasmodium falciparum restent asymptomatiques Acronyme du projet : FRM GATTATA MALARIA Durée globale du projet : 1 an Description sommaire du projet : Le but de notre recherche est de comprendre les mécanismes génomiques et transcriptomiques qui permettent à P. falciparum d'établir une infection chronique et asymptomatique chez l'homme. Intitulé du poste à pourvoir : Le paludisme tue un demi-million d'enfants par an, cependant dans les zones endémiques, la plupart des infections par Plasmodium falciparum restent asymptomatiques Mission principale : Nous testons des hypothèses basées sur des cultures in vitro avec des isolats de terrain collectés dans des pays endémiques. Plus spécifiquement, nous caractérisons comment le parasite échappe au système immunitaire en changeant régulièrement ses antigènes de surface Définition des tâches à accomplir : Avec des collègues du Cameroun et du Ghana, nous avons récemment collecté une biobanque unique d'isolats de P. falciparum cryopréservés provenant d'individus symptomatiques et asymptomatiques. Nous visons à séquencer le génome et le transcriptome de ces parasites, y compris au niveau de la cellule unique (en collaboration avec l'Université de Copenhague et la London School of Hygiene & Tropical Medicine). En pratique, vous allez :
- Adapter certains isolats de P. falciparum à la culture in vitro
- Réaliser des extractions d'ADN et d'ARN du parasite
- Caractériser l'expression des gènes var par RT-PCR couplée au séquençage d'amplicons
- Déterminer la multiplicité de l'infection au sein de chaque isolat par séquençage d'amplicons d'ADN
- Utiliser la cytométrie en flux et SMARTseq pour séquencer le transcriptome du parasite
- Sélectionner des isolats adaptés à la culture pour l'expression de protéines spécifiques PfEMP1 avec des anticorps monoclonaux
- Passer les commandes de consommables et gérer le laboratoire au quotidien
- Optionnel : analyser les données en utilisant R
- Dispositifs de développement des compétences : accès à une grande offre de formation, préparation aux concours internes
- Jusqu'à 46 jours de congés / an (pour un temps plein à 38h30)
- Temps de travail aménageable
- Jusqu'à 2 jours de télétravail / semaine (selon les modalités de la charte de TT applicable à l'UM)
- Restauration collective
- Aide et prestations sociales
- Prise en charge partielle des abonnements au transport de la ville
- Accès aux activités sportives, culturelles et de loisirs de l'université
- Soutien à la parentalité : club de loisirs pour enfant, partenariat de crèches, jours enfant-malade
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