Ingénieur études en biologie cellulaire et moléculaire du cancer - h/f

Description entreprise :

L’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l’innovation dans les traitements et la recherche en santé publique.

Rejoindre l’Inserm, c’est intégrer un institut engagé pour la parité et l’égalité professionnelle, la diversité et l’accompagnement de ses agents en situation de handicap, dès le recrutement et tout au long de la carrière. Afin de préserver le bien-être au travail, l’Inserm mène une politique active en matière de conditions de travail, reposant notamment sur un juste équilibre entre vie personnelle et vie professionnelle.

L'Inserm a reçu en 2016 le label européen HR Excellence in Research et s'est engagé à faire évoluer ses pratiques de recrutement et d'évaluation des chercheurs.

Description du poste :

L’IRCM développe des recherches cognitives, multidisciplinaires et appliquées dans le domaine de la cancérologie. Ces recherches impliquent des chercheurs et des cliniciens et visent à comprendre les différentes étapes de la tumorigénèse, et in fine, à identifier de nouvelles stratégies diagnostiques et thérapeutiques contre le cancer. Le thème fédérateur de l’Institut est, « Cibles moléculaires et thérapie des cancers, Découverte, Biologie et Applications Cliniques ». Sous la tutelle conjointe de l'Inserm, de l'ICM et de l'Université de Montpellier, l'IRCM rassemble aujourd'hui plus de 290 personnes, chercheurs, cliniciens, techniciens et étudiants, organisés en 19 équipes de recherche qui s'appuient sur des plateaux techniques et des services supports compétents.

Mission principale :

La personne recrutée aura pour principale mission de caractériser, par des approches de biologie cellulaire et moléculaire, l’activité anti-tumorale et le mécanisme d’action de nouveaux dérivés de la streptomycine ciblant les cellules initiatrices de tumeurs (TICs) dans le cancer colorectal, et de contribuer à l’identification de leurs cibles intracellulaires par des approches de protéomique et de RNA-seq.

Activités principales :

• Réaliser les tests fonctionnels d’inhibition de la formation de tumorsphères sur les lignées cellulaires de cancer colorectal (T84, SW480, SW620, HT-29)
• Évaluer la production d’espèces réactives de l’oxygène (ROS) et le mécansime de mort cellulaire induites par les dérivés de la streptomycine
• Mesurer la viabilité des cellules cancéreuses non-TIC et des cellules non cancéreuses pour caractériser la sélectivité des composés
• Analyser les données de protéomique et de RNA-seq afin d’identifier les cibles intracellulaires des dérivés (ARN ribosomiques procaryotes et mitochondriaux)
• Contribuer à la validation expérimentale des cibles identifiées (cartographie des domaines d’interaction, mutants dominants-négatifs)
• Évaluer par RNA-seq l’absence d’effets hors-cible des dérivés les plus prometteurs
• Rédiger les comptes rendus d’expériences et présenter les résultats lors des réunions d’équipe

Spécificité(s) et environnement du poste :

La personne recrutée intègrera l’équipe « Epoitranscriptomics and cancer adaptation » de l’IRCM et travaillera en étroite collaboration avec l’équipe de chimiste, responsable de la synthèse chimique des dérivés de streptomycine. Elle interviendra exclusivement sur le volet biologique du projet (tests fonctionnels in vitro, protéomique, RNA-seq). Elle pourra utiliser les plateaux techniques de l’institut (protéomique, séquençage, imagerie).

Profil recherché :

Connaissances :

• Connaissance approfondie de la biologie des cellules initiatrices de tumeurs et des mécanismes de mort cellulaire (stress oxydatif, ferroptose)
• Connaissance approfondie des techniques de culture cellulaire, de tests fonctionnels in vitro et d’analyse de données de protéomique et de RNA-seq
• Connaissance approfondie de la réglementation en matière d’hygiène et de sécurité
• Connaissance approfondie des bonnes pratiques de laboratoire

Savoir-faire :

• Maîtriser les techniques de culture cellulaire et les tests fonctionnels (formation de tumorsphères, viabilité, mort cellulaire)
• Mettre en œuvre des approches de protéomique et analyser des données de RNA-seq
• Analyser et interpréter des données expérimentales complexes
• Capacité à rédiger et présenter ses données scientifiques de manière rigoureuse
• Capacité à interagir efficacement avec les différents acteurs scientifiques du projet

Aptitudes :

• Faire preuve de rigueur, d’autonomie et d’esprit critique dans la conduite des expérimentations
• Travailler en équipe et communiquer avec des interlocuteurs de disciplines différentes (biologie, chimie)
• S’adapter à un environnement de recherche pluridisciplinaire et à l’évolution du projet

Expérience(s) souhaité(s) :

• Première expérience en biologie cellulaire et moléculaire appliquée à l’oncologie souhaitée (culture cellulaire, tests fonctionnels, protéomique et/ou analyse de données RNA-seq)